RNA干擾(RNAi)是一種轉(zhuǎn)錄后基因沉默的機(jī)制,同時也是一項成熟的實驗技術(shù),它改變了研究人員研究哺乳動物基因表達(dá)的方式,并持續(xù)為如今的基因功能研究提供有價值的實驗結(jié)果。 RNAi技術(shù)大大提高了在哺乳動物細(xì)胞和動物模型中進(jìn)行基因功能缺失分析的便利性、速度和特異性,因此長期以來一直是深受研究人員信賴的一種選擇。而小干擾RNA(siRNA)作為RNAi技術(shù)中最為常用的一種手段,近年來作為一種潛在治療性產(chǎn)品備受關(guān)注。
RNAi 是一種幾乎適用于所有真核生物體內(nèi)功能缺失研究的特異、有效且非常成功的研究方法。賽默飛世爾科技已開發(fā)出兩類能在 RNAi 中發(fā)揮功能的小 RNA 分子:小干擾 RNA(siRNA)分子和 microRNA (miRNA)。賽默飛世爾科技為體外和體內(nèi)RNAi 分析提供了多種產(chǎn)品,包括高通量應(yīng)用的文庫。具體應(yīng)選用的工具取決于您的模式系統(tǒng)、基因敲低所需的時間長度以及其他實驗參數(shù)。
RNAi是將與mRNA對應(yīng)的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導(dǎo)入細(xì)胞,可以使mRNA發(fā)生特異性的降解,導(dǎo)致其相應(yīng)的基因沉默。它可以用來研究基因功能的新工具,研究信號傳導(dǎo)通路的新途徑,還可以開展基因治療的新策略。?
基因過表達(dá)技術(shù)經(jīng)常被用于分析基因功能及其在醫(yī)學(xué)研究中的作用。不過,由過表達(dá)所引起的表型可能未反映出基因的真實功能。研究者也經(jīng)常使用顯性失活變異體;不過這些變異體并不適用于每一個蛋白,而且也可能獲得難于解釋的實驗結(jié)果。人們也研發(fā)出敲除小鼠用于理解蛋白功能。此方法費力而且昂貴,并且可能導(dǎo)致胚胎致死表型。研究者也可使用反義RNA和核酶,不過這些技術(shù)都無法適用于所有的靶點,而且RNAi技術(shù)的效力比其他這些方法都要強(qiáng)大。
人類基因組包含了數(shù)以千計可作為藥物靶點的基因。RNAi技術(shù)能夠被高效地用于靶點驗證操作,進(jìn)而對相關(guān)的基因進(jìn)行鑒定和功能評估。RNAi技術(shù)還被應(yīng)用于先導(dǎo)化合物或信號通路響應(yīng)的相關(guān)研究中,作為評估基因表達(dá)標(biāo)記的工具。總而言之,通過研發(fā)如Stealth™ RNAi一類的穩(wěn)定修飾分子或慢病毒傳遞技術(shù)等體內(nèi)的高效研究應(yīng)用,RNAi技術(shù)將成為動物模型強(qiáng)大研究工具。
RNA干擾(RNAi)簡史
圖1.RNAi的演化
RNA干擾(RNAi)是分子生物學(xué)領(lǐng)域最為重要的一項技術(shù)突破,它讓我們能夠在哺乳動物系統(tǒng)中直接觀察特定基因的功能缺失效應(yīng)。
在1990年代早期,一些科學(xué)家分別獨立在植物和真菌中觀察到RNA能夠抑制蛋白表達(dá)的現(xiàn)象(圖1)。這一現(xiàn)象雖然得到鑒定,但尚未被理解,當(dāng)時被稱為轉(zhuǎn)錄后“基因沉默"和“抑制"(quelling)。在1998年,Fire和Mello在秀麗隱桿線蟲中發(fā)現(xiàn)雙鏈RNA(dsRNA)是蛋白表達(dá)序列特異性抑制現(xiàn)象的來源,他們將其稱為“RNA干擾"(RNA interference)。由于向哺乳動物細(xì)胞遞送用于RNAi的長雙鏈RNA會受到非特異性的抑制,因此這時RNAi作為一種研究工具僅限于低等動物,這一階段線蟲的相關(guān)研究也得到很大促進(jìn)。由于發(fā)現(xiàn)了RNA干擾現(xiàn)象,Fire和Mello贏得了2006年的諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎。
在植物和無脊椎動物中的進(jìn)一步研究證實了導(dǎo)致RNAi效應(yīng)的實際分子是長度為21核苷酸的短雙鏈RNA寡聚物,其內(nèi)源的加工酶被稱為“Dicer"。“Dicer"降解產(chǎn)物簡稱為“短干擾RNA",如今以“siRNA"的名字廣為人知。隨后在2001年,siRNA被證實能夠直接在哺乳動物細(xì)胞中介導(dǎo)siRNA作用,而不會引發(fā)非特異性效應(yīng)。
今天,我們對RNAi途徑中的組件有了更全面的理解,包括這些組件行使其功能的效率,細(xì)胞mRNA序列識別和降解的特異性,以及設(shè)計和生成極其有效的RNAi試劑的多種關(guān)鍵需求。我們對于全新化學(xué)法的分析將進(jìn)一步提升此項技術(shù)的效能,并幫助將其用于體內(nèi)分析,如有可能,我們還會將RNAi技術(shù)應(yīng)用于潛在的治療用途。
RNAi的應(yīng)用
RNAi技術(shù)能夠針對基因組內(nèi)數(shù)以千計可能貢獻(xiàn)疾病表型的潛在基因,開展鑒定和功能分析。此外,RNAi技術(shù)還提供了阻斷特定基因表達(dá),以及評估化合物反應(yīng)或信號通路改變的高效手段。
RNA干擾(RNAi)工作原理
RNAi技術(shù)利用了細(xì)胞自身天然的分子機(jī)器,通過短干擾RNA分子的促進(jìn)作用,來高效地敲低所關(guān)注基因的表達(dá)水平。現(xiàn)有多種途徑來誘導(dǎo)產(chǎn)生RNAi,包括合成分子、RNAi載體和體外切割(圖2)。在哺乳動物細(xì)胞中,雙鏈RNA的短小片段——短干擾RNA(short interference RNA,siRNA)引發(fā)了胞內(nèi)靶標(biāo)mRNA的特異性降解作用。
在這一過程中,siRNA雙鏈中的反義鏈成為多蛋白復(fù)合物——或稱RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RISC)——的一部分,該復(fù)合物會識別對應(yīng)的mRNA并在特定位點將其切割降解。之后,此信使RNA降解產(chǎn)物即會成為降解作用的靶分子,最終(被消除而)導(dǎo)致蛋白表達(dá)的缺失。

圖2.哺乳動物中的RNAi敲低方法
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