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CAL Fluor Orange 560 Amidite是一種用于寡核苷酸合成的熒光標記試劑
閱讀：13 發布時間：2025-10-31熒光特性：
外觀：橙紅色固體。
吸收波長：537 nm。
發射波長：558 nm。
穩定性：對光敏感，長時間暴露在光下可能會導致光漂白。該產品在開放或未干燥的環境中容易被氧化。未使用的亞磷酰胺溶液可以在氬氣下保存，其功能可維持長達24小時。
基本參數：
中文名：CAL Fluor Orange 560 亞磷酰胺
英文名：CAL Fluor Orange 560 Amidite，Cal Fluor Orange 560 Amidite
分子式：C40H53F6N5O4P2
分子量：843.82
規格標準：1mg、5mg、10mg
試劑廠家：陜西新研博美生物科技有限公司
合成方法：
CAL Fluor Orange 560 Amidite 的合成方法
CAL Fluor Orange 560 Amidite 是一種用于寡核苷酸合成的熒光標記試劑，通常通過以下步驟合成：
熒光染料的合成：先合成 CAL Fluor Orange 560 熒光染料。
連接到亞磷酰胺基團：將熒光染料通過化學反應連接到亞磷酰胺基團上，使其可用于寡核苷酸合成。
合成條件：建議使用快速脫保護的亞磷酰胺。在稀釋前確保所有產品都在瓶底，稀釋至推薦濃度并充分混合。
使用方法：
稀釋：
將 CAL Fluor Orange 560 Amidite 稀釋至100 µmol/mL。
取用時需確保干燥，避免頻繁的溶解和凍干。
標記位置：
該亞磷酰胺不含有DMT保護基團，因此只能加到寡核苷酸的5'末端。
保存條件：
存儲條件為 -20°C，運輸條件為常溫。
取用后需充入惰性氣體，封口膜封口，擰緊瓶蓋裝入自封袋，及時放入冰箱。
脫保護條件：
在2-甲氧乙胺（Ald# 241067-50）和甲醇（1:3）中60°C下反應3小時。過濾樣品并蒸發上清液。將標記的寡核苷酸重新溶解在水中。
相關應用：
1. 實時定量PCR（qPCR）
CAL Fluor Orange 560 Amidite 是一種用于實時定量PCR的熒光標記試劑，具有以下應用：
5'核酸酶檢測：用于標記熒光探針的5'端，與BHQ-1黑洞淬滅劑配合使用。
分子信標：標記熒光探針的5'端，用于分子信標實驗。
Scorpions®引物：標記熒光探針的5'端，用于Scorpions®引物實驗。
多重qPCR：可替代VIC和HEX染料，用于多重qPCR實驗，與其他熒光染料（如FAM、TAMRA等）配合使用。
2. 熒光標記
寡核苷酸標記：可用于標記合成寡核苷酸的5'端或內部，廣泛應用于基因組分析。
熒光探針合成：用于合成熒光探針，應用于基因組分析。
3. 熒光共振能量轉移（FRET）
FRET實驗：標記的寡核苷酸可以作為供體或受體，用于FRET實驗。
4. 基因分析
基因組檢測：用于合成熒光探針，應用于基因組檢測。
SNP基因分型：用于標記熒光探針，用于SNP基因分型。
5. 熒光原位雜交（FISH）
FISH探針：用于制備橙色的FISH探針，在顯微鏡下對特定DNA或RNA序列進行定位。
6. 微陣列探針
基因芯片探針：用于基因芯片上的探針標記。
結構式：
相關試劑產品：
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