檢測范圍與變異類型:靶向覆蓋 523 個腫瘤相關基因,涵蓋單核苷酸變異(SNV)、插入缺失(Indel)、拷貝數變異(CNV)、基因融合四大變異類型,同時支持微衛星不穩定性(MSI)與腫瘤突變負荷(TMB)計算,單個試劑盒即可完成腫瘤分子分型所需的核心檢測內容,無需多試劑盒組合,實驗效率提升 60%。
靈敏度與特異性:采用 “超覆蓋度探針" 設計,每堿基覆蓋 30-50 條探針,針對 FFPE 組織樣本中 0.5% VAF 的突變,檢出率穩定達 98%,假陽性率<0.1%—— 在某三甲醫院開展的 100 例肺腺癌 FFPE 樣本檢測中,該試劑盒對 EGFR 19Del、L858R 等常見突變的檢出率與 Sanger 測序一致,對低頻突變(0.5%-1% VAF)的檢出率較傳統試劑盒提升 40%。
樣本兼容性:專為臨床 FFPE 樣本優化,配備 TruSeq FFPE DNA Repair Mix 修復模塊,可修復甲醛固定導致的 DNA 交聯與斷裂,修復效率達 80%,支持 DNA 用量低至 40ng、RNA 用量 40-80ng,即使對降解嚴重(DNA 片段<100bp、RNA 完整性數 RIN≥2.0)的 FFPE 樣本,仍能保持 85% 以上的檢測成功率,解決臨床珍貴樣本檢測難題。
靈敏度與樣本用量:基于分子標識符(UMI)技術,對血漿中 0.2% VAF 的 SNV 檢出率≥95%,分析特異性≥99.995%(針對≥0.5% VAF 小變異),僅需 4mL 血漿即可提取 20ng 循環游離 DNA(cfDNA)完成檢測 —— 在某腫瘤中心開展的結直腸癌化療療效監測研究中,該試劑盒能穩定捕獲治療后患者血漿中 0.15% VAF 的 KRAS 突變,較傳統 ctDNA 試劑盒靈敏度提升 2 倍,提前 2-3 個月預警疾病進展。
抗干擾能力:試劑體系添加血紅蛋白清除劑與游離 RNA 酶,可去除血漿中 90% 以上的血紅蛋白(避免抑制 PCR 反應)與游離 RNA(減少非特異性擴增),在溶血樣本(血紅蛋白濃度>5g/L)中的檢測成功率仍達 90%,而傳統試劑盒在該條件下檢測失敗率超 50%。
檢測效率:從核酸純化到變異報告僅需 3-4 天,文庫制備可在 1 天內完成,搭配 Illumina Dragen 二次分析流程,可自動生成突變注釋、TMB 計算、MSI 評分等結果,大幅縮短科研周期 —— 某科研團隊利用該試劑盒,30 天內完成 50 例胰腺癌患者的 ctDNA 動態監測,成功篩選出 2 個與化療耐藥相關的低頻突變位點。
覆蓋均勻性與 PCR 偏差控制:采用無 PCR 擴增的文庫構建方式,避免高 GC 區域(如啟動子、重復序列)的擴增偏差,在 GC 含量 40%-70% 的區域,測序覆蓋度 CV 值<8%,對人類基因組中 99.5% 的區域實現有效覆蓋 —— 在黑色素瘤全基因組研究中,該試劑盒成功檢測到 TERT 啟動子(GC 含量>65%)的高頻突變,而傳統 PCR 擴增試劑盒因該區域擴增效率低,漏檢率達 30%。
測序質量與數據產出:支持全基因組測序深度 30×-100×,測序數據 Q30 值穩定>90%,單樣本數據量可達 90GB(30× 深度),可精準檢測單核苷酸變異、插入缺失、拷貝數變異及結構變異(如染色體易位、大片段缺失)—— 某科研團隊利用該試劑盒構建的肝癌全基因組突變圖譜,發現 2 個與肝癌轉移相關的結構變異熱點區域,相關成果發表于《Nature Communications》。
樣本與平臺兼容性:支持新鮮冷凍組織、細胞系等高質量 DNA 樣本,DNA 用量僅需 1μg,兼容 Illumina 全系列測序平臺,在 NovaSeq X 系列平臺上,單次運行可處理 32-96 個樣本,單位樣本測序成本較 NextSeq 550 平臺降低 60%,適合大規模腫瘤隊列研究。
數據穩定性與質量:v2.5 版本試劑采用優化的流動池設計,起始熒光強度提升 15%,運行過程中信號衰減率<5%,300-cycle 高輸出試劑盒的最大數據產出量達 120GB,Q30 值穩定>90%,在 150 例乳腺癌樣本的 HER2 基因擴增檢測中,數據重復性 CV 值<3%,檢測結果與熒光原位雜交(FISH)技術一致性達 98%。
通量與運行時間:提供高輸出與中輸出兩種試劑規格,高輸出試劑盒單次運行可產生 400M 個簇,支持 8-36 個樣本的同時檢測;中輸出試劑盒可產生 130M 個簇,適合 4-12 個樣本的快速檢測,300-cycle 運行時間僅需 37 小時,較傳統測序試劑縮短 20%,滿足科研項目的快速周轉需求。
質控與可追溯性:試劑配備 PhiX v3 測序對照,可實時監控測序過程中的堿基識別 accuracy 與簇生成效率;采用射頻識別(RFID)編碼耗材,可追溯試劑生產批次、有效期等信息,符合《臨床基因檢測質量管理規范》,為腫瘤臨床轉化研究提供合規性保障。
參數應用:依托試劑盒 40ng DNA 用量、0.5% VAF 檢出率的參數優勢,成功從 18 例降解樣本(DNA 片段<150bp)中檢測出 EGFR、ALK、ROS1 等突變,其中 3 例檢出 0.6%-0.9% VAF 的低頻 EGFR T790M 突變,為患者后續靶向治療方案調整提供依據。
研究成果:通過該試劑盒的 CNV 檢測功能,發現 30% 的 ALK 融合患者伴隨 MET 基因擴增,提示這部分患者可能對 ALK 抑制劑聯合 MET 抑制劑更敏感,相關結論為臨床聯合用藥研究提供了新思路。
參數應用:憑借試劑盒 0.2% VAF 靈敏度、4mL 血漿用量的參數特性,在治療 2 周期后,28 例患者檢測到 ctDNA 突變 VAF 下降>50%,其中 25 例后續影像學評估為疾病穩定(SD)或部分緩解(PR);8 例患者 ctDNA VAF 持續升高,后續均出現疾病進展(PD),監測靈敏度達 92%。
研究價值:該試劑盒的 TMB 計算功能顯示,高 TMB(>20 mut/Mb)患者的化療客觀緩解率較中低 TMB 患者高 40%,為結直腸癌患者的化療療效預測提供了新的分子標志物。
參數應用:利用試劑盒無 PCR 偏差、高 GC 區域覆蓋均勻的優勢,在 TERT 啟動子(GC 含量 68%)檢測到高頻突變(突變率 43%),同時發現 2 個新的結構變異位點(染色體 1p36 缺失、7q34 易位),這些變異在傳統 PCR 擴增試劑盒的測序數據中未被檢出。
轉化意義:通過全基因組突變圖譜分析,發現結構變異位點附近存在 2 個與黑色素瘤轉移相關的候選基因,為后續功能驗證研究奠定了基礎,相關成果已申請 2 項國家發明。
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